Biyotop akvaryumları, sadece bir bölgenin canlıları ve o bölgede bol bulunan malzemelerin benzerleriyle kurulmuşl akvaryumlardır. Haliyle bu akvaryumlarda beslenecek bitkiler de sadece o bölgeye ait olmalıdır. Bubitkiler seçilirken seçilen balıkların da bu bitkilere zarar verip vermeyeceği göz önüne alınmalıdır.